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基腐病又称为枯萎病。由半知菌亚门真菌、腐霉、致病镰刀菌等多种菌以及细菌作用引起的病变。往往发生在近土表茎基部的叶鞘部位，发生的有水浸状椭圆形斑，随着病害的加深，而变成深褐色中间枯白的不规则斑纹，剖开表皮可见植株主干发黑溃烂，并伴有恶臭。植株则从缓慢生长到停止生长，逐渐枯萎变黄、落叶，死去。
百合的基腐病发病后球根基盘产生褐色腐烂，沿鳞片向上发展，染病的鳞片则从侧面脱落，病害逐渐发展到深层，由此，地上部分的植株矮小，黄叶，生长缓慢或停止。
水稻基腐病病株根节基部变为褐色或深褐色腐烂，区别与细菌性褐条病，心腐病，白叶枯病及螟害枯心病。常常与小球菌核病，恶苗病，和还原性物质中毒等病同时发生。
玉米基腐病又称青枯病，一般是从灌浆期到乳熟期开始发病，到蜡熟期现象病发高峰期。发病症状可见外皮和髓部变软，溃烂，发黑，有水渍样，伴有恶臭，植株表现为枯黄，倒伏。玉米茎基腐病就是以镰刀孢菌和腐霉菌在种子和土壤中过冬，次年当玉米幼苗生长期，借雨水或者机械损伤侵入植株，待温湿适宜的情况下快速发展，在植株的茎根部发作。
草莓作物在连续接茬种植的时候更容易发生基腐病害，是以一种卵菌纲疫霉侵染所致。在大棚和低洼土地上易于出现。发病时茎基部皮层呈淡褐色或黑褐色，在移栽定植时往往容易忽略打理，可在一周到10天的时间里快速发生发展，大量草莓株叶片发黄，掰开茎部木质部变褐色。特别时在夏季高温高湿的环境中容易爆发。
作物的基腐病害也能通过加强田间管理而避免或者减少发生。如加强田间沉积腐叶的清理、避免重插连种、减少种植密度、开沟起垄、覆膜遮蔽以及科学施肥浇水等。
