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微生物菌剂是目标微生物（有效菌）经过工业化生产扩繁后加工制成的活菌制剂。产品剂型有液体、粉剂、颗粒型。
按照其中含有的微生物种类或功能特性分为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、促生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂等。执行标准是GB 20287-2006。
据相关统计，优质微生物菌剂的增产率可以达到10%以上。同样的果园同样的管理，使用微生物菌剂的水果个头更均匀。不仅如此，微生物菌剂也大大减少了用药成本。同时，微生物菌剂还有其独特的8大作用。
1、促进作物快速生长
2、调节作物生命活动，增产增收
3、提高果实品质
4、分解有机物质和毒素，防止重茬
5、保护根系健康，阻止病菌入侵
6、增强抗逆性，抗病、抗虫能力加强
7、能松土保肥、改善环境，减少板结
8、有益菌刺激有机质释放营养
而现在市场上有机肥一般含有机质45，再有就是氮磷钾含有5个10个12个。增施有机肥，不断提高土壤有机质含量是提高土壤肥力的主要环节。
有机质能够增加土壤的通气性、透水性、蓄水性以及改善根系生长环境使土壤保水保肥能力增强。
但是微生物菌剂即含有氮磷钾大量元素和部分有机质，主要是添加了微生物活性菌种，从生产成本上必定是高于有机肥的。微生物菌剂虽然比有机肥贵一点，但从最终增产增收效果来说，微生物菌剂反而更加划算！
